全光譜小動物活體成像系統可用于評估疫苗的免疫保護效果。標記疫苗抗原和免疫細胞，將疫苗接種到動物體內后，通過成像系統觀察免疫細胞對疫苗抗原的識別、攝取和呈遞過程，以及免疫細胞的活化、增殖和分化情況。在研究疫苗誘導的體液免疫和細胞免疫反應時，可實時監測抗體產生和免疫細胞在體內的分布和功能變化。通過對比接種疫苗和未接種疫苗動物在病原體感染后的成像結果，能夠直觀評估疫苗的免疫保護效果，為疫苗研發和優化提供科學依據。
全光譜小動物活體成像系統為中藥復方藥效機制研究提供了新途徑。標記中藥復方中的有效成分或與藥效相關的生物分子，將中藥復方給予動物后，通過成像系統觀察藥物成分在體內的吸收、分布、代謝和作用靶點。在研究中藥復方治療疾病的作用機制時，可實時監測藥物對疾病相關生物過程的調節作用，如對炎癥反應、細胞凋亡、基因表達等的影響。系統的多組學分析功能，能夠綜合評估中藥復方的藥效物質基礎和作用機制，為中藥現代化研究提供技術支持。
