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既然PQQ只能由某些細菌合成，那么植物、動物和人體中的PQQ又是從何而來呢?目前，科學界普遍認為，動物和人類腸道中雖然也有種類數量不等的細菌，但這些細菌都不能合成PQQ或合成量極少，根本無法滿足身體需要。因此，動物和人類只能通過飲食途徑獲取PQQ。但是，植物體內的PQQ是從環境中吸收還是自己合成，或者兩者兼而有之，這一問題至今還沒有明確答案。經典的植物化學理論認為，植物能夠利用根系吸收的水和無機鹽為原料合成自身需要的一切有機化合物。由此推測，植物本身也可能像細菌一樣自行合成PQQ這種小分子有機化合物。這一切都有待于未來科學家們的深入研究揭曉答案。

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